A gyár kezdetben Duntochner néven indult útjára, aminek megemlítésére már a 19. század elejéről is találhatunk nyomokat. A mostani nevét később, 1834-ben vette fel a Lowland és Lowlander között található lepárló.Bár a második világháború során lebombázták, 1948-ban megkezdődött a rekonstrukció, amelynek következtében egy új és modern Auchentoshan épült fel. Néhány évvel ezelőtt, 2008-ban felújították az üzemet, átalakultak a címkék valamint az épület fekvése, és a látogatóközpontot is korszerűsítették. A lepárló nem egy világvégi skót mezőn fekszik, mint ahogy azt egy skót lepárlótól elvárnánk, hanem Glasgow városában működik. Ezt egyik fő jellemzőjükként is sokszor említik, az Auchentoshan része a városnak, és a város része az Auchentoshannak, úgy mondják, itt találkozik a kézműves minőség, és a városiakat jellemző progresszív gondolkodásmód. Az itt készült whiskyk jellemzője a háromszori lepárlás, ez ugyan egy drágább megoldás, de a cég úgy gondolja, csak így lehet igazán minőségi terméket előállítani.Az Auchentoshan Single Malt whisky a Lowland vidékéről származik. Háromszoros lepárlás után háromféle hordóban érlelődik. Először használt bourbon-ös, majd oloroso sherrys, végül PX sherrys hordóban. Ennek köszönheti rendkívül gazdag, cseresznyérem csokoládéra, erdei gyümölcsökre és karamellre emlékeztető ízét, melyeket fás, zöld gyümölcsökre emlékeztető aromák kísérnek.
